Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms