Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig3P97386 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig3P97386 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig3P97386 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms