Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TnikP83510 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TnikP83510 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TnikP83510 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TnikP83510 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TnikP83510 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnikP83510 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnikP83510 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TnikP83510 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnikP83510 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnikP83510 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnikP83510 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnikP83510 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnikP83510 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms