Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smad1P70340 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms