Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx1P70314 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms