Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux2P70298 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux2P70298 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux2P70298 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux2P70298 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cux2P70298 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cux2P70298 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux2P70298 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms