Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms