Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chl1P70232 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms