Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DccP70211 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DccP70211 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DccP70211 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DccP70211 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DccP70211 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DccP70211 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DccP70211 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DccP70211 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DccP70211 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DccP70211 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DccP70211 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DccP70211 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DccP70211 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DccP70211 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DccP70211 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DccP70211 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DccP70211 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DccP70211 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DccP70211 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DccP70211 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DccP70211 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DccP70211 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DccP70211 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms