Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms