Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra1P62812 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms