Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm6P62313 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm6P62313 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm6P62313 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm6P62313 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm6P62313 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm6P62313 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm6P62313 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm6P62313 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm6P62313 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm6P62313 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm6P62313 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm6P62313 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm6P62313 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm6P62313 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm6P62313 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm6P62313 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm6P62313 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms