Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr3bP59470 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms