Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms