Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Senp1P59110 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Senp1P59110 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Senp1P59110 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms