Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtnsP57757 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms