Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc4rP56450 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms