Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp5P56399 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms