Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdaP56389 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdaP56389 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdaP56389 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms