Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PitpnbP53811 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms