Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PctpP53808 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PctpP53808 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PctpP53808 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PctpP53808 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PctpP53808 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PctpP53808 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms