Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms