Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms