Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms