Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms