Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl9P51670 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl9P51670 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms