Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cxcl5P50228 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cxcl5P50228 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cxcl5P50228 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cxcl5P50228 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cxcl5P50228 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl5P50228 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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