Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms