Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igfbp3P47878 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igfbp3P47878 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igfbp3P47878 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms