Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr7P47774 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr7P47774 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms