Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf1P46099 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms