Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms