Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx1-2P42580 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms