Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TfamP40630 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TfamP40630 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TfamP40630 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TfamP40630 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TfamP40630 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TfamP40630 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TfamP40630 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TfamP40630 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TfamP40630 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms