Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd1P40201 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd1P40201 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd1P40201 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd1P40201 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd1P40201 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms