Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf2P39429 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms