Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik2P39087 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms