Protein–RNA interactions for Protein: P35802

Gpm6a, Neuronal membrane glycoprotein M6-a, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpm6aP35802 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpm6aP35802 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpm6aP35802 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpm6aP35802 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpm6aP35802 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpm6aP35802 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpm6aP35802 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpm6aP35802 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpm6aP35802 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpm6aP35802 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpm6aP35802 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpm6aP35802 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms