Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola1P33609 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pola1P33609 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pola1P33609 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pola1P33609 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms