Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc11P31313 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms