Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd28P31041 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd28P31041 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms