Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd1P30999 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms