Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VtnP29788 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VtnP29788 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VtnP29788 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VtnP29788 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VtnP29788 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VtnP29788 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VtnP29788 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VtnP29788 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VtnP29788 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VtnP29788 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms