Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pabpc1P29341 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pabpc1P29341 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms