Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms