Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprmP28828 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprmP28828 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprmP28828 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprmP28828 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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