Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GrnP28798 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GrnP28798 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GrnP28798 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GrnP28798 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GrnP28798 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms