Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms