Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpbP27048 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms