Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tln1P26039 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tln1P26039 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tln1P26039 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tln1P26039 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tln1P26039 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tln1P26039 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tln1P26039 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tln1P26039 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tln1P26039 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tln1P26039 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tln1P26039 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tln1P26039 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tln1P26039 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tln1P26039 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tln1P26039 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms